Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAMTA1Q9Y6Y1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CAMTA1Q9Y6Y1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CAMTA1Q9Y6Y1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CAMTA1Q9Y6Y1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms