Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q9Y3F1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q9Y3F1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q9Y3F1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q9Y3F1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Q9Y3F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q9Y3F1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q9Y3F1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9Y3F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9Y3F1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Q9Y3F1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Q9Y3F1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Q9Y3F1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms