Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMC9Q9Y3B6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMC9Q9Y3B6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMC9Q9Y3B6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC9Q9Y3B6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms