Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT52Q9Y366 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFT52Q9Y366 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT52Q9Y366 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT52Q9Y366 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms