Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR55Q9Y2T6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR55Q9Y2T6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR55Q9Y2T6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR55Q9Y2T6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR55Q9Y2T6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR55Q9Y2T6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR55Q9Y2T6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR55Q9Y2T6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR55Q9Y2T6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR55Q9Y2T6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPR55Q9Y2T6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms