Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUDCQ9Y266 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NUDCQ9Y266 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NUDCQ9Y266 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NUDCQ9Y266 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NUDCQ9Y266 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUDCQ9Y266 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms