Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PDZRN3Q9UPQ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PDZRN3Q9UPQ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDZRN3Q9UPQ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PDZRN3Q9UPQ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PDZRN3Q9UPQ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDZRN3Q9UPQ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDZRN3Q9UPQ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms