Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFSF18Q9UNG2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFSF18Q9UNG2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFSF18Q9UNG2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms