Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF19Q9UMS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF19Q9UMS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF19Q9UMS4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF19Q9UMS4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF19Q9UMS4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms