Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN11Q9UMQ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN11Q9UMQ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN11Q9UMQ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN11Q9UMQ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms