Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB23Q9ULC3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB23Q9ULC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB23Q9ULC3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB23Q9ULC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms