Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TSKSQ9UJT2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSKSQ9UJT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSKSQ9UJT2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSKSQ9UJT2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSKSQ9UJT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSKSQ9UJT2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSKSQ9UJT2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSKSQ9UJT2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSKSQ9UJT2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TSKSQ9UJT2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSKSQ9UJT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSKSQ9UJT2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms