Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUFIP1Q9UHK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUFIP1Q9UHK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUFIP1Q9UHK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUFIP1Q9UHK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms