Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA9Q9UGM1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNA9Q9UGM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNA9Q9UGM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNA9Q9UGM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms