Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNQ9P2M7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CGNQ9P2M7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CGNQ9P2M7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms