Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COX16Q9P0S2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COX16Q9P0S2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COX16Q9P0S2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms