Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP1BQ9NZR2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRP1BQ9NZR2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms