Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SACSQ9NZJ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SACSQ9NZJ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms