Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPG21Q9NZD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPG21Q9NZD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPG21Q9NZD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPG21Q9NZD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPG21Q9NZD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPG21Q9NZD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPG21Q9NZD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPG21Q9NZD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPG21Q9NZD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPG21Q9NZD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SPG21Q9NZD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms