Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL39Q9NYK5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL39Q9NYK5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL39Q9NYK5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL39Q9NYK5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms