Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM53CQ9NYF3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM53CQ9NYF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM53CQ9NYF3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM53CQ9NYF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms