Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHP2Q9NX24 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NHP2Q9NX24 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NHP2Q9NX24 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NHP2Q9NX24 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NHP2Q9NX24 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHP2Q9NX24 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHP2Q9NX24 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHP2Q9NX24 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NHP2Q9NX24 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms