Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3EQ9NVU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR3EQ9NVU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR3EQ9NVU0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POLR3EQ9NVU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLR3EQ9NVU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms