Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAJC17Q9NVM6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAJC17Q9NVM6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNAJC17Q9NVM6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNAJC17Q9NVM6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNAJC17Q9NVM6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNAJC17Q9NVM6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms