Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NDFIP2Q9NV92 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDFIP2Q9NV92 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDFIP2Q9NV92 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDFIP2Q9NV92 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms