Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BIN3Q9NQY0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BIN3Q9NQY0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BIN3Q9NQY0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BIN3Q9NQY0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BIN3Q9NQY0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BIN3Q9NQY0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BIN3Q9NQY0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BIN3Q9NQY0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BIN3Q9NQY0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BIN3Q9NQY0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms