Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM9Q9NQV7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM9Q9NQV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDM9Q9NQV7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM9Q9NQV7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms