Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ86

TRIM36, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM36Q9NQ86 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM36Q9NQ86 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM36Q9NQ86 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM36Q9NQ86 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM36Q9NQ86 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM36Q9NQ86 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms