Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASS4Q9NQ75 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASS4Q9NQ75 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASS4Q9NQ75 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASS4Q9NQ75 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms