Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC52A3Q9NQ40 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC52A3Q9NQ40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC52A3Q9NQ40 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC52A3Q9NQ40 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.3 ms