Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCFQ9NPI8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCFQ9NPI8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCFQ9NPI8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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