Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPV4Q9HBA0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPV4Q9HBA0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPV4Q9HBA0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPV4Q9HBA0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRPV4Q9HBA0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRPV4Q9HBA0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPV4Q9HBA0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPV4Q9HBA0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPV4Q9HBA0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms