Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SELENOOQ9BVL4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SELENOOQ9BVL4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SELENOOQ9BVL4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SELENOOQ9BVL4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOOQ9BVL4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms