Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKNK1Q9BUB5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MKNK1Q9BUB5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MKNK1Q9BUB5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKNK1Q9BUB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MKNK1Q9BUB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms