Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSG1Q9BU20 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSG1Q9BU20 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSG1Q9BU20 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms