Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDFIP1Q9BT67 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDFIP1Q9BT67 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms