Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNS3Q9BQ31 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNS3Q9BQ31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNS3Q9BQ31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms