Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPAS1Q99742 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS1Q99742 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS1Q99742 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPAS1Q99742 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms