Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC6Q99741 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC6Q99741 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC6Q99741 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC6Q99741 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC6Q99741 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC6Q99741 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms