Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHP1Q99653 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHP1Q99653 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHP1Q99653 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHP1Q99653 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHP1Q99653 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHP1Q99653 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHP1Q99653 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms