Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY1Q96T51 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY1Q96T51 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY1Q96T51 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY1Q96T51 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY1Q96T51 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms