Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOX2Q96NM4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOX2Q96NM4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TOX2Q96NM4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOX2Q96NM4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TOX2Q96NM4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOX2Q96NM4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms