Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD2Q96M20 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNBD2Q96M20 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNBD2Q96M20 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD2Q96M20 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms