Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SERAC1Q96JX3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SERAC1Q96JX3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SERAC1Q96JX3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SERAC1Q96JX3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.8 ms