Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP6Q96FZ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP6Q96FZ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP6Q96FZ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP6Q96FZ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms