Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO1Q96FE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINGO1Q96FE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINGO1Q96FE5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LINGO1Q96FE5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINGO1Q96FE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms