Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SGF29Q96ES7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGF29Q96ES7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGF29Q96ES7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGF29Q96ES7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGF29Q96ES7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms