Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHFRQ96EP1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHFRQ96EP1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHFRQ96EP1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHFRQ96EP1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms