Protein–RNA interactions for Protein: Q96DP5

MTFMT, Methionyl-tRNA formyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTFMTQ96DP5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTFMTQ96DP5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTFMTQ96DP5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTFMTQ96DP5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTFMTQ96DP5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms