Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TLCD1Q96CP7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLCD1Q96CP7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TLCD1Q96CP7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLCD1Q96CP7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms